Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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ZNF239Q16600 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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