Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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