Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZFHX3Q15911 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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