Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
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NEDD8Q15843 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
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NEDD8Q15843 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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NEDD8Q15843 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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NEDD8Q15843 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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NEDD8Q15843 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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NEDD8Q15843 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
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NEDD8Q15843 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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NEDD8Q15843 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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NEDD8Q15843 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD8Q15843 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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