Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms