Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms