Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms