Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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