Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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