Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE7AQ13946 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms