Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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