Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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TCOF1Q13428 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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TCOF1Q13428 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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TCOF1Q13428 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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TCOF1Q13428 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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TCOF1Q13428 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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TCOF1Q13428 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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TCOF1Q13428 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCOF1Q13428 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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