Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
XRCC4Q13426 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 340.5 ms