Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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