Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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SEMA3FQ13275 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SEMA3FQ13275 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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