Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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SEMA3BQ13214 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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SEMA3BQ13214 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SEMA3BQ13214 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3BQ13214 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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