Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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GPS1Q13098 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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