Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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TRDNQ13061 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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TRDNQ13061 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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TRDNQ13061 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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TRDNQ13061 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRDNQ13061 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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