Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
BPTFQ12830 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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