Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN12Q05209 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms