Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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CENPFP49454 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPFP49454 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPFP49454 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPFP49454 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPFP49454 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
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CENPFP49454 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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CENPFP49454 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPFP49454 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPFP49454 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
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CENPFP49454 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPFP49454 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPFP49454 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPFP49454 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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CENPFP49454 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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CENPFP49454 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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CENPFP49454 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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CENPFP49454 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPFP49454 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPFP49454 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPFP49454 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPFP49454 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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