Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COPS7AQ9UBW8 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms