Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SH3BP4Q9P0V3 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms