Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms