Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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