Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZFHX3Q15911 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms