Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
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PTPRRQ15256 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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PTPRRQ15256 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRRQ15256 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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