Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms