Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SMC1AQ14683 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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