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| SEMA3A | Q14563 | AP003497.1-201 | ENST00000528472 | 562 nt | BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.79 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC084819.1-201 | ENST00000537293 | 424 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.79 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092745.2-201 | ENST00000537764 | 620 nt | TSL 3 BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.79 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | FER-210 | ENST00000628534 | 558 nt | TSL 5 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC112487.2-201 | ENST00000637950 | 304 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PARP15-206 | ENST00000493645 | 1311 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SERPINI2-209 | ENST00000616363 | 1769 nt | TSL 5 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CEP170-202 | ENST00000366542 | 6828 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00648-202 | ENST00000555985 | 2885 nt | TSL 2 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SERPINI2-201 | ENST00000264677 | 1678 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR6C2-203 | ENST00000641516 | 1682 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | XRCC4-203 | ENST00000396027 | 1530 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SENP7-204 | ENST00000394085 | 1483 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HSFY2-201 | ENST00000304790 | 1444 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HSFY1-201 | ENST00000307393 | 1444 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS4Y1-201 | ENST00000250784 | 1305 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNY1P12-201 | ENST00000364251 | 105 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SPRR2D-203 | ENST00000368757 | 800 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DEFB109C-201 | ENST00000382575 | 264 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DEFB109B-201 | ENST00000382656 | 264 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1009P-201 | ENST00000390996 | 107 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU4-55P-201 | ENST00000410731 | 137 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS7P15-201 | ENST00000415804 | 584 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PIGFP2-201 | ENST00000421400 | 651 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL136322.1-201 | ENST00000422250 | 548 nt | TSL 4 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTCO1P20-201 | ENST00000425366 | 358 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009961.2-201 | ENST00000435771 | 251 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PATE1-202 | ENST00000437148 | 457 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HMGN2P20-201 | ENST00000437531 | 273 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL049734.2-201 | ENST00000441066 | 616 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RAC1P7-201 | ENST00000445367 | 377 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HSFY6P-201 | ENST00000445573 | 403 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092620.2-201 | ENST00000458007 | 744 nt | TSL 2 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC055855.1-201 | ENST00000489563 | 579 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TRBV12-2-201 | ENST00000489763 | 344 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC079382.1-201 | ENST00000493346 | 557 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC093278.1-201 | ENST00000494700 | 600 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ACTR3BP4-201 | ENST00000503033 | 1244 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |