Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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UBE4AQ14139 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UBE4AQ14139 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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