Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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COL9A2Q14055 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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COL9A2Q14055 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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COL9A2Q14055 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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COL9A2Q14055 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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