Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms