| RUNX2 | Q13950 | KCNT2-202 | ENST00000367433 | 5883 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNF38-210 | ENST00000611646 | 5185 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NCAPGP1-201 | ENST00000505112 | 1814 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KCNIP4-207 | ENST00000509207 | 1301 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGSF11-AS1-201 | ENST00000477009 | 1604 nt | TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MBNL1-220 | ENST00000493459 | 4205 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADAM28-201 | ENST00000265769 | 7052 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR423-201 | ENST00000362201 | 94 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP124-201 | ENST00000362739 | 110 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.159-201 | ENST00000363674 | 87 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.296-201 | ENST00000364930 | 108 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA62.3-201 | ENST00000365110 | 153 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TCEAL7-202 | ENST00000372666 | 852 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PARD3-204 | ENST00000374768 | 799 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR554-201 | ENST00000384874 | 96 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-278P-201 | ENST00000390945 | 109 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL159169.1-201 | ENST00000421119 | 127 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P109-201 | ENST00000422213 | 475 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590783.1-201 | ENST00000424138 | 456 nt | TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS3AP44-201 | ENST00000425466 | 790 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO2P19-201 | ENST00000427513 | 598 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ACBD3-AS1-201 | ENST00000440540 | 535 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TXNP1-201 | ENST00000441872 | 371 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTATP6P30-201 | ENST00000443540 | 664 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CEACAMP4-201 | ENST00000457676 | 421 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL034349.1-201 | ENST00000458367 | 549 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091153.1-201 | ENST00000466297 | 402 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL542P-201 | ENST00000467147 | 294 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MEF2C-AS1-212 | ENST00000514158 | 713 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP143-201 | ENST00000516936 | 115 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P5-201 | ENST00000517906 | 940 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM92A1P1-201 | ENST00000528023 | 890 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090023.1-201 | ENST00000545750 | 443 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009269.3-201 | ENST00000558429 | 472 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP005205.1-201 | ENST00000563503 | 508 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TPRKBP2-201 | ENST00000565969 | 475 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01909-202 | ENST00000584919 | 815 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GLUD1P4-201 | ENST00000590914 | 418 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BNIP3P22-201 | ENST00000593399 | 556 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01515-204 | ENST00000595269 | 402 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001172.2-201 | ENST00000602454 | 467 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR92B-201 | ENST00000607575 | 96 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF250324.2-201 | ENST00000608299 | 610 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP002826.1-201 | ENST00000608835 | 315 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GPR171-203 | ENST00000617554 | 960 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MUCL1-205 | ENST00000619042 | 243 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026585.1-201 | ENST00000619582 | 524 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PIGX-211 | ENST00000639474 | 777 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PHTF2-201 | ENST00000248550 | 4778 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPEF2-203 | ENST00000440995 | 5964 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CD36-221 | ENST00000534394 | 1741 nt | TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MFSD8-236 | ENST00000641509 | 4050 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CNGA1-201 | ENST00000358519 | 2627 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DMXL1-201 | ENST00000311085 | 11072 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | STEAP4-202 | ENST00000380079 | 9988 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138915.3-201 | ENST00000562908 | 1389 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EIF2AK2-204 | ENST00000405334 | 1533 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SERPINI2-201 | ENST00000264677 | 1678 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAPK10-373 | ENST00000641983 | 6772 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NEB-204 | ENST00000409198 | 20637 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DST-201 | ENST00000244364 | 16742 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CEP44-201 | ENST00000296519 | 4173 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADGRL2-210 | ENST00000370728 | 6302 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD56.2-201 | ENST00000363242 | 71 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP322-201 | ENST00000363617 | 119 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-89P-201 | ENST00000384592 | 164 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TANK-204 | ENST00000403609 | 555 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1290-201 | ENST00000408735 | 78 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RHEBP3-201 | ENST00000411920 | 351 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAB9AP3-201 | ENST00000412737 | 573 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC245054.1-201 | ENST00000420944 | 258 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL160272.1-201 | ENST00000421509 | 521 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353148.1-204 | ENST00000426752 | 477 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02095-201 | ENST00000430908 | 346 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL023693.1-201 | ENST00000434255 | 216 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007389.2-201 | ENST00000434630 | 306 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS15AP9-201 | ENST00000439856 | 381 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAB9AP1-201 | ENST00000449393 | 573 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092162.2-204 | ENST00000451851 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL93P-201 | ENST00000463035 | 293 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL049714.1-201 | ENST00000466686 | 347 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010273.2-201 | ENST00000479830 | 438 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS3AP14-201 | ENST00000483907 | 780 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ENSA-210 | ENST00000503241 | 574 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359273.1-203 | ENST00000506295 | 602 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS3A-208 | ENST00000509736 | 576 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359273.1-201 | ENST00000510918 | 627 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-506P-201 | ENST00000516553 | 94 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-45P-201 | ENST00000517191 | 141 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023632.4-201 | ENST00000517783 | 191 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021736.1-201 | ENST00000521143 | 563 nt | TSL 4 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPINK7-205 | ENST00000523535 | 299 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM60DP-201 | ENST00000524174 | 632 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL358937.1-201 | ENST00000524512 | 336 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003718.1-201 | ENST00000529884 | 583 nt | TSL 4 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087318.1-201 | ENST00000536786 | 389 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL845331.3-202 | ENST00000562856 | 261 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007342.4-202 | ENST00000565189 | 721 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC034105.4-201 | ENST00000568304 | 277 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003465.2-201 | ENST00000602571 | 373 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |