Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GTF2H3Q13889 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms