Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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TCIRG1Q13488 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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TCIRG1Q13488 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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TCIRG1Q13488 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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TCIRG1Q13488 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCIRG1Q13488 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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