Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MSLNQ13421 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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