Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SRSF6Q13247 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms