Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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BPTFQ12830 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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BPTFQ12830 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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