Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB40BQ12829 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RAB40BQ12829 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RAB40BQ12829 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms