Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms