Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATRXP46100 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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