Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATP9BO43861 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms