Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CRXO43186 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CRXO43186 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CRXO43186 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CRXO43186 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms