Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FAM53CQ9NYF3 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms