Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms