Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LIN28AQ9H9Z2 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms