Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VGLL1Q99990 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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VGLL1Q99990 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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VGLL1Q99990 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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VGLL1Q99990 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VGLL1Q99990 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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