Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms