Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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LRRIQ1Q96JM4 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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LRRIQ1Q96JM4 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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LRRIQ1Q96JM4 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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LRRIQ1Q96JM4 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRIQ1Q96JM4 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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